ХІ МІЖНАРОДНА ЛІТНЯ ШКОЛА «МОЛЕКУЛЯРНА МІКРОБІОЛОГІЯ І БІОТЕХНОЛОГІЯ»
6 - 23 червня 2016 року
Одеса, Шампанський пров. 2, Біологічний факультет,
каф. мікробіології, вірусології та біотехнології
Пн 6 червня
10.00 – 10.50 Офіційне відкриття ХІ Міжнародної Літньої школи.
11.00 – 13.00 Лабораторне заняття. Титрування фагів (к.б.н. Іваниця Т.В.)
13.00 – 14.00 Обід
14.00 – 17.00 Лабораторне заняття. Температурна індукція лізогена E. coli С600 [P1::Tn9 (Cmсts 100)] (к.б.н. Жумінська Г.І.)
11.00 – 13.00 Лабораторне заняття. Препаративне одержання фагових часток. Метод злитного лізису чутливої культури. (к.б.н. Іваниця Т.В.)
13.00 – 14.00 Обід
14.00 – 16.00 Лабораторне заняття. Трансформація бактеріальних клітин. (к.б.н. Сергєєва Ж.Ю.)
16.00 – 17.00 Лабораторне заняття. Температурна індукція лізогена E. coli С600 [P1::Tn9 (Cmсts 100)]. (к.б.н. Жумінська Г.І.)
Ср 8 червня
9.00 – 10.10 Лекція. Д.б.н, Марченко Михайло Маркович, Чернівецький національний університет імені Юрія Федьковича «Молекулярні механізми дії есенціальних мікронутрієнтів»
10.20 – 11.30 Лекція. К.б.н. Ліманська Н.В. «Agrobacterium tumefaciens: унікальний механізм переносу генетичної інформації в геном еукаріотних організмів»
11.40 – 13.30 Лабораторне заняття. Концентрування фагових часток методом ПЕГ-преципітації (процедура Ямамото). ( к.б.н. Іваниця Т.В.)
13.30 – 14.00 Обід
14.00 – 17.00 Лабораторне заняття. Температурна індукція лізогена E. coli С600 [P1::Tn9 (Cmсts 100)]. (к.б.н. Жумінська Г.І.)
Чт 9 червня
9.00 – 10.10 Лекція. К.б.н. Гергалова Г.Л. «Підвищення обізнаності та освіти з біобезпеки та біозахисту в Україні»,
10.20 – 11.30 Лекція. К.б.н. Галкін М.Б. «Біоплівки. Структура, молекулярні механізми формування та біологічна роль»
11.40 – 13.30 Лабораторне заняття. Виділення плазмід. Електрофорез. (к.б.н. Сергєєва .Ж.Ю.)
13.30 – 14.00 Обід
14.00 – 16.00 Лабораторне заняття. Виділення фагової ДНК. (к.б.н. Крилова К. Д.)
16.00 – 17.00 Лабораторне заняття. Температурна індукція лізогена E. coli С600 [P1::Tn9 (Cmсts 100)]. (к.б.н. Жумінська Г.І.)
Пт 10 червня
9.00 – 10.10 Лекція. Д.б.н. Товкач Ф.І. «Геноміка профагів і острови патогенності. Фагова лізогенна конверсія. Фагові токсини. Концепція «моронів». Острови патогенності і системи секреції ІІІ типу».
10.20 – 11.30 Лекція. К.б.н. Юрченко О.О. «Використання методу секвенування для вивчення вірусів».
11.40 – 13.30 Лабораторне заняття. Виділення фагової ДНК. (к.б.н. Крилова К. Д.) Рестрикційний аналіз. (к.б.н. Сергєєва .Ж.Ю.)
13.30 – 14.00 Обід
14.00 – 17.00 Лабораторне заняття. Температурна індукція лізогена E. coli С600 [P1::Tn9 (Cmсts 100)]. (к.б.н. Жумінська Г.І.)
Сб 11 та Нд 12 червня
Вихідні дні
Пн 13 червня
9.00 – 10.10 Лекція Jon Bent Kristoffersen (Hellenic Centre for Marine Research, PhD)
«An introduction to next-generation sequencing. Methods and practical
application. Sequencing technologies, library preparation, shotgun sequencing, metabarcoding, 16s rRNA, metagenomics».
10.20 – 11.30 Семінар. М.н.с. Боброва О.Є. «Метагеномний аналіз. Робота з нуклеотидними послідовностями. Програми біоінформативного аналізу для вивчення біологічної та функціональної різноманітності».
11.40 – 13.30 Лабораторне заняття. Електрофорез фагової ДНК. (к.б.н. Крилова К. Д.)
13.30 – 14.00 Обід
14.00 – 17.00 Лабораторне заняття. Температурна індукція лізогена E. coli С600 [P1::Tn9 (Cmсts 100)]. (к.б.н. Жумінська Г.І.)
Вт 14 червня
9.00 – 10.10 Лекція. Д.б.н. Товкач Ф.І. «Геноміка плазмід. Плазмідні детермінанти патогенності. Вектори на основі плазмід. Молекулярна генетика плазміди pTi – С58 Agrobacterium tumеfaciens. Трансгенні рослини».
10.20 – 11.30 Лекція. К.б.н. Васильєва Н.Ю. «Поняття нумеричної таксономії. Ієрархічні алгоритми. Використання кластерного аналізу в нумеричній таксономії і філогенії».
11.40 – 13.30 Лабораторне заняття. Полімеразна ланцюгова реакція (ПЛР). Електрофорез продуктів ПЛР. (к.б.н. Ліманська Н.В.)
13.30 – 14.00 Обід
14.00 – 17.00 Лабораторне заняття. Полімеразна ланцюгова реакція (ПЛР). Електрофорез продуктів ПЛР. (к.б.н. Ліманська Н.В.)
Ср 15 червня
9.00 – 10.50 Лекція. Д.б.н. Товкач Ф.І. «Бактеріальні транспозони. ІS-елементи, інтегрони і генетичні касети. Формування множинної антибіотикорезистентності у бактерій. Концепція внутригеномних перебудов – геномний інженерінг». «Дефектні бактеріофаги і бактеріоцини. Роль у міжбактеріальному антагонізмі. Перспективи використання бактеріоцинів – типування бактерій, біоконтроль бактеріальних популяцій і терапія раку».
11.00 – 13.00 Семінар К.б.н. Степанова Т.Ю. «Інфодень програми Горизонт 2020: Light up your research career. Програми мобільности для молодих вчених».
13.00 – 14.00 Обід
14.00 – 17.00 Семінар ОНУ зав. лаб. ІТ і ТЗН Афонін С.А. «Віртуальні лабораторії у біологічних дослідженнях».
Чт 16 червня
9.00 – 10.10 Лекція. Д.б.н. Іваниця В.О. «Сучасний погляд на еволюцію мікроорганізмів».
10.20 – 11.30 Лекція. К.б.н. Васильєва Н.Ю. «Поняття про кластерний аналіз. Методи кластерного аналізу. Алгоритми прямої класифікації. Визначення кластерів. Алгоритми розрахунку кластерного аналізу, які використовуються в біології. Критерії якості класифікації».
11.40 – 13.30 Лабораторне заняття. Електрофорез у поліакриламідному гелі. (к.б.н. Остапчук А.М.)
13.30 – 14.00 Обід
14.00 – 17.00 Лабораторне заняття. Розділення білків методом вертикального електрофорезу. (к.б.н. Остапчук А.М.)
Пт 17 червня
9.00 – 10.30 Лекція. Д.б.н. Товкач Ф.І. «Автономні генетичні елементи бактерій. Інсерційні послідовності, транспозони, системи рестрикції-модифікації, плазміди, бактеріофаги, острівки і острови патогенності. Ієрархія і мобільність автономних генетичних елементів, Роль автономних генетичних елементів у формуванні патогенності у бактерій».
10.40 – 13.00 Лабораторне заняття. Методи хроматографічного розділення. Принципи рідинної хроматографії. Сучасне обладнання для хроматографії. Іонообмінна та гель фільтраційна хроматографія. (к.б.н. Остапчук А.М.)
13.00 – 14.00 Обід
14.00 – 17.00 Лабораторне заняття. Ідентифікація мікроорганізмів за спектром жирних кислот з використанням методу газової хроматографії і системи MIDI Sherlock. (к.б.н. Остапчук А.М.)
Сб 18 та Нд 19 червня
Вихідні дні
Пн 20 червня
9.00 – 10.30 Лекція. Thomas Haertlé «Harnessing of lactic acid bacteria for the reduction of immunogenicities».
10.40 – 13.00 Лабораторне заняття. Знайомство з основними пакетами програм, які застосовуються у філогенії (програми on-line) (к.б.н. Васильєва Н.Ю.)
13.00 – 14.00 Обід
14.00 – 17.00 Лабораторне заняття. Програма аналізу первинної послідовності і побудова на її основі філограм. (к.б.н. Васильєва Н.Ю.)
Вт 21 червня
9.00 – 13.00 Лабораторне заняття. Застосування кластерного аналізу при побудові родинних зв'язків. (пакет MatLab). (к.б.н. Васильєва Н.Ю.)
13.00 – 14.00 Обід
14.00 – 17.00 Лабораторне заняття. Побудова філограм за допомогою комп'ютерних програм (пакет MatLab) (к.б.н. Васильєва Н.Ю.)
Ср 22 червня
9.00 – 13.00 Лабораторне заняття. Побудова філограм за допомогою комп'ютерних програм Множинне вирівнювання як попередній етап при аналізі родинних зв'язків (пакет MatLab). (к.б.н. Васильєва Н.Ю.)
13.00 – 14.00 Обід
14.00 – 17.00 Лабораторне заняття. Множинне вирівнювання як попередній етап при аналізі родинних зв'язків (пакет MatLab) (к.б.н. Васильєва Н.Ю.)
Чт 23 червня
11.00 – 13.00 Закриття ХI Міжнародної Літньої школи.